Neues von der Arbeit

Und wieder ein Eintrag zu meiner Bachelorarbeit ;).

Erstmal, ein tolles OpenSource-Programm: PyMol
Damit kann man super Moleküle betrachten, sehr einfach Videos machen usw. Es hat mir sehr geholfen die Rotationen zu überprüfen, weil sich die einzelnen Strukturen leicht überlagern und wieder ausblenden lassen. Außerdem kanns es die Indizes der Atome anzeigen und sowieso noch extrem viel mehr ;). Aber was für mich auch noch praktisch ist, ist dass es die Strukturen vergleichen kann, was danach dann auch betrachtet werden kann. Es berechnet also die maximale Überlappung der Strukturen. Das verwende ich ja auch in meinem Programm, allerdings mit dem Tinker-Programm "superpose". Das Einzige was beachtet werden sollte ist, dass PyMol zwar die Tiker-XYZ-Dateien unterstützt, aber sehr pingelig auf die Leerzeichen in der Datei achtet.

Ansonsten glaube ich mein Programm jetzt soweit zu haben, dass es die lokalen Minima berechnet und filtert.