Bachelorarbeit

Ich habe ja nun schon seit einige Tagen mit meiner Bachelorarbeit angefangen. Mein Thema ist "Optimierungsverfahren für die Untersuchung organischer Dimere". Dabei geht es darum ein Programm zu schreiben, dass zwei Moleküldefinitionen nimmt, diese in verschiedenen Anordnungen gegeneinander Ausrichtet und so möglichst alle Minima der Strukturen findet. Die Energie und die Optimierung werden dabei von einem externen Programm, Tinker, erledigt.
So weit, so gut. Ich muss mich nun langsam wieder dran machen, deshalb nur noch eben eine Notiz:
Heute habe ich mich dafür entschieden, die Atomklassen miteinander zu verknüpfen und nicht die Beads. Dann kann ich darüber zumindest die Konnektivität reproduzieren.