Moin
Endlich funktioniert die Drehung der Moleküle ordentlich, nachdem ich einige Tage Fehler beheben musste. Zum Beispiel hatte ich lange Zeit nicht bemerkt, dass die Rotation nicht um den richtigen Winkel geschah, da die trigonometrischen Funktionen nur Radianten annehmen, aber keine Winkel in Grad. Außerdem sollte die Rotation um das andere Molekül als einfache Translation dargestellt werden. (Was es auch einfacher zu programmieren macht ;).) Naja und dabei kann man noch einige Berechnungen einsparen, da sich doppelte Anordnungen ergeben, wenn das Molekül nach der Rotation um eine Achse auf der anderen befindet.
Und nur noch eine Bemerkung nebenbei: Vektoren von Zeigern sind irgendwie mysteriös. Sollte man besser nicht verwenden ;). Hat zumindest bei mir zu sonderbaren Fehlern geführt.
Da jetzt das ausschreiben der XYZ-Dateien auch funktioniert, kann ich das ganze auch endlich visualisieren. Dafür eignet sich PyMol sehr gut. Zum Spaß habe ich daher mal ein kleines Video einer "Methanol-Kugel" gemacht.
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