Und es rechnet ...

Das QM-interface scheint nun größtenteils zu funktionieren. Nur bei der Optimierung der Dimere muss ich nochmal sehen, ob die Dateien auch wieder ordentlich geschrieben werden, nach der Optimierung. Das schien bei dem einen fertigen bisher nicht so wirklich der Fall zu sein. Aber ich denke nun auch den Fehler gefunden zu haben, warum die Limitierung auf nur hydrophile Beads nicht funktioniert hatte. Ich hatte natürlich vergessen auf hydrophobe Beads zu überprüfen (besser gesagt die hydrophoben des ersten/einen Moleküls). Achja, wens interessiert: So eine Optimierung eines Dimers dauert etwa 22 Stunden.